Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSRP1P21291 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRP1P21291 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRP1P21291 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms