Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF1AP20823 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF1AP20823 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms