Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms