Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms