Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRHP20396 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TRHP20396 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRHP20396 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRHP20396 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRHP20396 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms