Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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