Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PYGBP11216 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PYGBP11216 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PYGBP11216 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PYGBP11216 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PYGBP11216 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PYGBP11216 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PYGBP11216 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PYGBP11216 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PYGBP11216 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PYGBP11216 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PYGBP11216 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PYGBP11216 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms