Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX5BP10606 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX5BP10606 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX5BP10606 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX5BP10606 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX5BP10606 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX5BP10606 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms