Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCATP04180 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCATP04180 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCATP04180 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms