Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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