Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F9P00740 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
F9P00740 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
F9P00740 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F9P00740 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F9P00740 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
F9P00740 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F9P00740 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F9P00740 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F9P00740 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
F9P00740 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
F9P00740 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
F9P00740 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
F9P00740 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
F9P00740 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
F9P00740 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
F9P00740 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
F9P00740 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F9P00740 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F9P00740 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F9P00740 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms