Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYF2O95926 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms