Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRATO95237 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRATO95237 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRATO95237 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms