Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCATO75600 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCATO75600 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCATO75600 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCATO75600 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms