Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms