Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms