Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN2BO60939 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN2BO60939 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN2BO60939 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN2BO60939 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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