Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNCRIPO60506 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms