Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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