Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1GO43497 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms