Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms