Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCAO15360 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCAO15360 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCAO15360 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCAO15360 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCAO15360 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCAO15360 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCAO15360 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCAO15360 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCAO15360 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCAO15360 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCAO15360 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCAO15360 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCAO15360 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms