Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms