Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3EO15041 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3EO15041 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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