Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms