Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QRK9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QRK9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QRK9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QRK9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QRK9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms