Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GOLGA8SH3BPF8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GOLGA8SH3BPF8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms