Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BMQ9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BMQ9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMQ9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMQ9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMQ9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMQ9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMQ9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMQ9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMQ9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms