Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DXG7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms