Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms