Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V9GY05 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V9GY05 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V9GY05 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms