Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms