Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms