Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms