Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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SNX13Q9Y5W8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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SNX13Q9Y5W8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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SNX13Q9Y5W8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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