Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP16Q9Y5T5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms