Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF5Q9Y2D1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms