Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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