Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms