Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms