Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms