Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms