Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms