Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms