Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms