Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD2

GLTP, Glycolipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPQ9NZD2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GLTPQ9NZD2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLTPQ9NZD2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms