Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXL2Q9NZ53 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms