Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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