Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms