Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms